MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA3

Total Repeats: 2713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009780	TCT	2	6	864	869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936547
2	NC_009780	T	6	6	936	941	0 %	100 %	0 %	0 %	156936547
3	NC_009780	TCT	2	6	962	967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936547
4	NC_009780	CAT	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936547
5	NC_009780	GC	3	6	1030	1035	0 %	0 %	50 %	50 %	156936547
6	NC_009780	CG	4	8	1131	1138	0 %	0 %	50 %	50 %	156936547
7	NC_009780	CT	3	6	1179	1184	0 %	50 %	0 %	50 %	156936547
8	NC_009780	CGC	2	6	1303	1308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936547
9	NC_009780	CGG	2	6	1310	1315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936547
10	NC_009780	TCGC	2	8	1320	1327	0 %	25 %	25 %	50 %	156936547
11	NC_009780	TCT	2	6	1343	1348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936547
12	NC_009780	CGC	2	6	1370	1375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936547
13	NC_009780	CTG	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936547
14	NC_009780	CGT	2	6	1397	1402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936547
15	NC_009780	GC	3	6	1426	1431	0 %	0 %	50 %	50 %	156936547
16	NC_009780	CTC	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936547
17	NC_009780	CGG	2	6	1513	1518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936547
18	NC_009780	CCG	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936548
19	NC_009780	CGC	2	6	1741	1746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936548
20	NC_009780	CGG	2	6	1765	1770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936548
21	NC_009780	GGT	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936548
22	NC_009780	TAA	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936548
23	NC_009780	GGT	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936548
24	NC_009780	CCA	2	6	1908	1913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936548
25	NC_009780	CAC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936548
26	NC_009780	CGG	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936548
27	NC_009780	GTT	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936548
28	NC_009780	AGT	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936548
29	NC_009780	CTG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936548
30	NC_009780	GCT	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936548
31	NC_009780	GCGT	2	8	2064	2071	0 %	25 %	50 %	25 %	156936548
32	NC_009780	CAG	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936548
33	NC_009780	CGG	2	6	2167	2172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936548
34	NC_009780	CTG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936548
35	NC_009780	GGT	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936548
36	NC_009780	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	156936548
37	NC_009780	TGG	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936549
38	NC_009780	CTGG	2	8	2608	2615	0 %	25 %	50 %	25 %	156936549
39	NC_009780	GCG	2	6	2706	2711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936549
40	NC_009780	ATT	2	6	2742	2747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936549
41	NC_009780	TGC	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936549
42	NC_009780	GTG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936549
43	NC_009780	CG	3	6	2881	2886	0 %	0 %	50 %	50 %	156936549
44	NC_009780	CGC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936549
45	NC_009780	CG	3	6	2922	2927	0 %	0 %	50 %	50 %	156936549
46	NC_009780	TGC	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936549
47	NC_009780	GTC	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936549
48	NC_009780	C	6	6	3020	3025	0 %	0 %	0 %	100 %	156936549
49	NC_009780	TCGC	2	8	3073	3080	0 %	25 %	25 %	50 %	156936549
50	NC_009780	TGG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936549
51	NC_009780	TGG	3	9	3113	3121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936549
52	NC_009780	GGC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936549
53	NC_009780	CTG	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936549
54	NC_009780	GTG	2	6	3178	3183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936549
55	NC_009780	A	6	6	3188	3193	100 %	0 %	0 %	0 %	156936549
56	NC_009780	GC	3	6	3204	3209	0 %	0 %	50 %	50 %	156936549
57	NC_009780	GCC	2	6	3211	3216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936549
58	NC_009780	CTGGT	2	10	3221	3230	0 %	40 %	40 %	20 %	156936549
59	NC_009780	CGC	2	6	3283	3288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936549
60	NC_009780	CCG	2	6	3305	3310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936549
61	NC_009780	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936549
62	NC_009780	CAG	2	6	3398	3403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936549
63	NC_009780	TTAA	2	8	3446	3453	50 %	50 %	0 %	0 %	156936549
64	NC_009780	GAC	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936549
65	NC_009780	CGA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936549
66	NC_009780	CG	3	6	3633	3638	0 %	0 %	50 %	50 %	156936550
67	NC_009780	TCG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936550
68	NC_009780	CAG	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936550
69	NC_009780	CGG	2	6	3672	3677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936550
70	NC_009780	CAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936550
71	NC_009780	CACG	2	8	3701	3708	25 %	0 %	25 %	50 %	156936550
72	NC_009780	TGCG	2	8	3720	3727	0 %	25 %	50 %	25 %	156936550
73	NC_009780	GAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936550
74	NC_009780	TGC	2	6	3755	3760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936550
75	NC_009780	ATT	2	6	3879	3884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936550
76	NC_009780	GCG	2	6	3903	3908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936550
77	NC_009780	GGT	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936550
78	NC_009780	CAGC	2	8	3999	4006	25 %	0 %	25 %	50 %	156936550
79	NC_009780	GC	3	6	4028	4033	0 %	0 %	50 %	50 %	156936550
80	NC_009780	CCG	2	6	4049	4054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936550
81	NC_009780	TC	4	8	4108	4115	0 %	50 %	0 %	50 %	156936550
82	NC_009780	GCCGCA	2	12	4124	4135	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	156936550
83	NC_009780	GCA	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936551
84	NC_009780	GGT	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936551
85	NC_009780	CCG	2	6	4672	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
86	NC_009780	GCC	2	6	4683	4688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
87	NC_009780	GCG	2	6	4691	4696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
88	NC_009780	CGG	2	6	4737	4742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
89	NC_009780	GTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936551
90	NC_009780	GCG	2	6	4797	4802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
91	NC_009780	GCC	2	6	4808	4813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
92	NC_009780	TGGCG	2	10	4846	4855	0 %	20 %	60 %	20 %	156936551
93	NC_009780	CG	3	6	4854	4859	0 %	0 %	50 %	50 %	156936551
94	NC_009780	GCG	3	9	4893	4901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
95	NC_009780	GGC	2	6	4903	4908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
96	NC_009780	GCC	2	6	4954	4959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
97	NC_009780	GCC	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
98	NC_009780	TGG	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936551
99	NC_009780	CGG	2	6	5001	5006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
100	NC_009780	GGT	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936551
101	NC_009780	GAC	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936551
102	NC_009780	GCG	2	6	5127	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
103	NC_009780	TGA	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936551
104	NC_009780	TGA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936551
105	NC_009780	CGC	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
106	NC_009780	ATGCAT	2	12	5183	5194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	156936551
107	NC_009780	CGC	2	6	5305	5310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936551
108	NC_009780	CGG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
109	NC_009780	CGG	2	6	5361	5366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
110	NC_009780	ACT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936551
111	NC_009780	GGA	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936551
112	NC_009780	TGA	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936551
113	NC_009780	TCT	2	6	5531	5536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936551
114	NC_009780	CTG	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936551
115	NC_009780	GTC	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936551
116	NC_009780	GCT	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936551
117	NC_009780	GCG	2	6	5629	5634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
118	NC_009780	GCG	3	9	5636	5644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936551
119	NC_009780	TTA	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936551
120	NC_009780	GA	3	6	5854	5859	50 %	0 %	50 %	0 %	156936552
121	NC_009780	T	6	6	5860	5865	0 %	100 %	0 %	0 %	156936552
122	NC_009780	AAT	2	6	5970	5975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936552
123	NC_009780	AT	3	6	5974	5979	50 %	50 %	0 %	0 %	156936552
124	NC_009780	GAT	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936552
125	NC_009780	CTT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936552
126	NC_009780	TCAG	2	8	6156	6163	25 %	25 %	25 %	25 %	156936553
127	NC_009780	AAT	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936553
128	NC_009780	GC	3	6	6242	6247	0 %	0 %	50 %	50 %	156936553
129	NC_009780	AGA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936553
130	NC_009780	GACC	2	8	6322	6329	25 %	0 %	25 %	50 %	156936553
131	NC_009780	GAT	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936553
132	NC_009780	CAA	2	6	6440	6445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936553
133	NC_009780	GGC	2	6	6470	6475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936553
134	NC_009780	ATG	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936553
135	NC_009780	CAG	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936553
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142	NC_009780	GC	3	6	7175	7180	0 %	0 %	50 %	50 %	156936554
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258	NC_009780	TCTT	2	8	13442	13449	0 %	75 %	0 %	25 %	156936562
259	NC_009780	ATC	2	6	13512	13517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936562
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261	NC_009780	CGC	2	6	13533	13538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936562
262	NC_009780	ACC	2	6	13625	13630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936562
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264	NC_009780	GC	3	6	13720	13725	0 %	0 %	50 %	50 %	156936562
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